Modèle de souche

La souche d`activation Model1 – 3, 5 est une approche basée sur des fragments, et la première étape nécessaire consiste donc à choisir des fragments de référence appropriés. Il y a la liberté de choix, mais pour les processus bimoléculaires que nous traiteront dans les sections suivantes, le choix évident et simple est d`utiliser les réactifs initiaux comme fragments de référence. Pour les réactions bimoléculaires par l`intermédiaire d`un état de transition (TS), le modèle de souche d`activation peut être utilisé pour obtenir des informations sur, par exemple, la hauteur d`une barrière de réaction. Ceci est fait en divisant son énergie à ce stade, ΔE ‡, dans le terme d`énergie de la souche ΔE ‡ Strain, et le terme d`énergie d`interaction ΔE ‡ int: le modèle de souche d`activation est un outil puissant pour comprendre la réactivité, ou l`inertie, des espèces moléculaires. Ceci est fait en rapportant l`énergie relative d`un complexe moléculaire le long du profil d`énergie de réaction à la rigidité structurelle des réactifs et la force de leurs interactions mutuelles: ΔE (é) = ΔEstrain (de) + ΔEint (de). Nous fournissons une discussion détaillée du modèle, et élaborons sur son lien étroit avec la théorie de l`orbitale moléculaire. À l`aide de ces approches, une relation causale est révélée entre les propriétés des réactifs et leur réactivité, par exemple les barrières de réaction et les mécanismes de réaction plausible. Cette méthodologie peut révéler des parallèles intrigants entre des types complètement différents de transformations chimiques. Ainsi, le modèle de souche d`activation constitue un cadre fédérateur qui favorise le développement de concepts transdisciplinaires dans divers domaines de la chimie.

Nous illustrons le modèle de souche d`activation en action avec des exemples sélectionnés de la littérature. Ces exemples démontrent comment la méthodologie est appliquée à différentes questions de recherche, comment les résultats sont interprétés, et comment les aperçus dans un phénomène chimique peuvent conduire à une meilleure compréhension d`un autre, apparemment complètement différent chimique Processus. Fils comput mol SCI 2015, 5:324 – 343. doi: 10.1002/wcms. 1221 ici, nous discutons brièvement de la signification des termes «théorie» et «modèle», qui figurent en bonne place dans le titre de cette revue, et apparaissent régulièrement tout au long de son contenu. Ce qui suit est un mot de prudence à garder dans le dos de l`esprit, et certainement pas une tentative de fournir une vue définitive sur les théories et les modèles et leur application dans la méthode scientifique. Le modèle de souche d`activation de la réactivité chimique fournit un aperçu qualitatif et quantitatif des profils énergétiques (ΔE) des processus chimiques en divisant l`énergie en un terme issu de la déformation géométrique des réactifs (ΔEstrain) et un terme comptabilisation des capacités de liaison mutuelle entre les réactifs (ΔEint).

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